ชุดตรวจหากรดนิวคลีอิกโคโรนาไวรัส (SARS-Cov-2) ใหม่
New Cออโรnavirus(SARS-Cov-2) Nucleic Acid Detection Kit
(Fluแร่scent RT-PCR Probe Method) Product Manual
-Pโรดักt name -ชุดตรวจจับกรดนิวคลีอิกโคโรนาไวรัส (SARS-Cov-2) ใหม่ (วิธีโพรบ RT-PCR ของฟลูออเรสเซนต์)
-Packaging specไอฟิcations -25 การทดสอบ/ชุด
-Intended usอายุ-
ชุดนี้ใช้สำหรับการตรวจหากรดนิวคลีอิกเชิงคุณภาพจากโคโรน่าไวรัสสายพันธุ์ใหม่ในผ้าเช็ดล้างจมูก ผ้าเช็ดคอหอย ผ้าเช็ดจมูกด้านหน้า ผ้าเช็ดทำความสะอาดจมูกปานกลาง ผ้าล้างจมูก และเครื่องดูดน้ำมูกจากบุคคลที่สงสัยว่าติดเชื้อโควิด 19 โดยผู้ให้บริการด้านการแพทย์ การตรวจหายีน ORF1ab และ N ของไวรัสโคโรนาสายพันธุ์ใหม่สามารถนำมาใช้ในการวินิจฉัยเสริมและการติดตามทางระบาดวิทยาของการติดเชื้อไวรัสโคโรนาสายพันธุ์ใหม่ได้
-Principles of the pโรซdure -
ชุดนี้ได้รับการออกแบบสำหรับโพรบ TaqMan เฉพาะและไพรเมอร์เฉพาะที่ออกแบบมาสำหรับลำดับยีน ORF1ab และ N ของไวรัสโคโรนาสายพันธุ์ใหม่ (SARS-Cov-2) โซลูชันปฏิกิริยา PCR ประกอบด้วยไพรเมอร์เฉพาะ 3 ชุดและโพรบฟลูออเรสเซนต์สำหรับการตรวจจับเป้าหมายเฉพาะ และชุดไพรเมอร์เฉพาะและโพรบฟลูออเรสเซนต์เพิ่มเติมอีกชุดหนึ่งถูกใช้เป็นการควบคุมมาตรฐานภายในของชุดอุปกรณ์สำหรับการตรวจจับยีนการดูแลภายนอก
หลักการทดสอบคือหัววัดฟลูออเรสเซนต์จำเพาะจะถูกย่อยและสลายโดยกิจกรรม exonuclease ของเอนไซม์ Taq ในปฏิกิริยา PCR เพื่อให้กลุ่มผู้รายงานฟลูออเรสเซนต์และกลุ่มฟลูออเรสเซนต์ดับลงเพื่อให้ระบบตรวจสอบการเรืองแสงสามารถรับฟลูออเรสเซนต์ได้ จากนั้นด้วยการเพิ่มประสิทธิภาพของการขยาย PCR สัญญาณเรืองแสงของโพรบจะถึงค่าเกณฑ์ที่ตั้งไว้-ค่า Ct (เกณฑ์วงจร) ในกรณีที่ไม่มีแอมพลิฟายเออร์เป้าหมาย กลุ่มผู้รายงานของโพรบจะอยู่ใกล้กับกลุ่มดับ ในเวลานี้ การถ่ายโอนพลังงานเรโซแนนซ์เรืองแสงเกิดขึ้น และการเรืองแสงของกลุ่มนักข่าวจะถูกดับโดยกลุ่มดับ ดังนั้นจึงไม่สามารถตรวจพบสัญญาณฟลูออเรสเซนต์ด้วยเครื่องมือ PCR เรืองแสง
เพื่อติดตามการใช้รีเอเจนต์ในระหว่างการทดสอบ ชุดอุปกรณ์นี้มาพร้อมกับส่วนควบคุมเชิงบวกและเชิงลบ โดยส่วนควบคุมเชิงบวกประกอบด้วยพลาสมิดรีคอมบิแนนท์ของตำแหน่งเป้าหมาย และส่วนควบคุมเชิงลบคือน้ำกลั่น ซึ่งใช้ในการตรวจสอบมลภาวะต่อสิ่งแวดล้อม ขอแนะนำให้ตั้งค่าการควบคุมเชิงบวกและการควบคุมเชิงลบพร้อมกันเมื่อทำการทดสอบ
-Main comโพเน็นts -
Cat. No. | BST-SARS-25 | BST-SARS-DR-25 | ส่วนประกอบents | |
น้ำe | ข้อมูลจำเพาะการทำให้เป็นรูปเป็นร่าง | ปริมาณความมีตัวตน | ปริมาณความมีตัวตน | |
การควบคุมเชิงบวก | 180 ไมโครลิตร/ขวด | 1 | 1 | พลาสมิดที่สร้างขึ้นเอง น้ำกลั่น |
การควบคุมเชิงลบ | 180 ไมโครลิตร/ขวด | 1 | 1 | น้ำกลั่น |
ผสม SARS-Cov-2 | 358.5 ไมโครลิตร/ขวด | 1 | / | คู่ไพรเมอร์เฉพาะ, โพรบฟลูออเรสเซนต์ตรวจจับเฉพาะ, dNTPs, , MgCl2, KCl, Tris-Hcl, น้ำกลั่น ฯลฯ |
เอนไซม์ผสม | 16.5 ไมโครลิตร/ขวด | 1 | / | เอนไซม์ Taq, Reverse Transcriptase, เอนไซม์ UNG ฯลฯ |
SARS-Cov-2 Mix (ไลโอฟิไลซ์) | 25 การทดสอบ/ขวด | / | 1 | คู่ไพรเมอร์เฉพาะ, โพรบฟลูออเรสเซนต์การตรวจจับเฉพาะ, dNTP, เอนไซม์ Taq, รีเวิร์สทรานสคริปเทส, น้ำกลั่น ฯลฯ |
2x บัฟเฟอร์ | 375 ไมโครลิตร/ขวด | / | 1 | MgCl2, KCl, Tris-Hcl, น้ำกลั่น ฯลฯ |
บันทึก-(1) ส่วนประกอบในชุดชุดที่แตกต่างกันไม่สามารถผสมหรือเปลี่ยนได้
(2) เตรียมรีเอเจนต์ของคุณเอง: ชุดสกัดกรดนิวคลีอิก
-Storage condฉันons และ expiration date -
For BST-SARS-25:ขนส่งและจัดเก็บที่อุณหภูมิ -20 ± 5 ℃ เป็นเวลานาน
For BST-SARS-DR-25:ขนส่งที่อุณหภูมิห้อง เก็บที่อุณหภูมิ -20 ± 5 ℃ เป็นเวลานาน
หลีกเลี่ยงการแช่แข็ง-ละลายซ้ำๆ ระยะเวลาที่ถูกต้องกำหนดไว้เบื้องต้นเป็นเวลา 12 เดือน
ดูฉลากสำหรับวันที่ผลิตและการใช้งาน
หลังจากเปิดครั้งแรก สารรีเอเจนต์สามารถเก็บไว้ที่อุณหภูมิ -20±5 ° C เป็นเวลาไม่เกิน 1 เดือนหรือจนกว่าจะสิ้นสุดระยะเวลาของรีเอเจนต์ แล้วแต่วันใดจะถึงก่อน เพื่อหลีกเลี่ยงรอบการแช่แข็ง-ละลายซ้ำ และจำนวนการแช่แข็งของรีเอเจนต์ - รอบการละลายไม่ควรเกิน 6 ครั้ง
-Applicable instrument-ABI 7500, SLAN-96P, โรช-LightCycler-480
-Sample requirements -
1.ประเภทตัวอย่างที่เกี่ยวข้อง: สารละลายกรดนิวคลีอิกที่สกัดแล้ว
2.การจัดเก็บตัวอย่างและการขนส่ง: เก็บที่อุณหภูมิ-20 ± 5 ℃เป็นเวลา 6 เดือน แช่แข็งและละลายตัวอย่างไม่เกิน 6 ครั้ง
-Tประมาณing metฮอด-
1.Nucleic acid extraction
เลือกชุดสกัดกรดนิวคลีอิกที่เหมาะสมเพื่อสกัดกรดนิวคลีอิกของไวรัส และปฏิบัติตามคำแนะนำในชุดอุปกรณ์ที่เกี่ยวข้อง ขอแนะนำให้ใช้ชุดสกัดและการทำให้บริสุทธิ์กรดนิวคลีอิกที่ผลิตโดย Yixin Bio-Tech (Guangzhou) Co., Ltd. หรือชุดการทำให้บริสุทธิ์กรดนิวคลีอิกที่เทียบเท่า
2. Rแต่ละtion รีจnt prepอาราtion
2.1 For BST-SARS-25:
(1) นำส่วนผสม SARS-Cov-2 และส่วนผสมของเอนไซม์ออก จากนั้นละลายให้หมดที่อุณหภูมิห้องผสมให้เข้ากันโดยใช้อุปกรณ์ Vortex จากนั้นจึงปั่นแยกเป็นเวลาสั้นๆ
(2) เติมเอนไซม์ผสม 16.5uL ลงในส่วนผสม SARS-Cov-2 358.5uL และผสมให้เข้ากันเพื่อให้ได้สารละลายปฏิกิริยาผสม
(3) เตรียมหลอดฐานแปด PCR ที่สะอาดขนาด 0.2 มล. และทำเครื่องหมายด้วยสารละลายปฏิกิริยาผสมข้างต้น 15uL ต่อหลุม
(4) เติมสารละลายกรดนิวคลีอิกบริสุทธิ์ 15 μL, กลุ่มควบคุมเชิงบวกและกลุ่มควบคุมเชิงลบ และปิดฝาหลอดฐานแปดอย่างระมัดระวัง
(5) ผสมให้เข้ากันโดยกลับด้าน และปั่นแยกอย่างรวดเร็วเพื่อให้ของเหลวเข้มข้นที่ด้านล่างของหลอด
1
2.2 For BST-เขตซาร์S-DR-25:
(1) เพิ่มบัฟเฟอร์ 375ul 2x ลงในส่วนผสม SARS-Cov-2 ((ไลโอฟิไลซ์) เพื่อเตรียมส่วนผสมของปฏิกิริยา ผสมให้ละเอียดโดยการปิเปตแล้วปั่นแยกเป็นเวลาสั้นๆ (เมื่อเตรียมส่วนผสมของปฏิกิริยาแล้ว แนะนำให้เก็บไว้ที่ -20°C ที่อุณหภูมิ การจัดเก็บข้อมูลระยะยาว)
(2) เตรียมหลอดฐานแปด PCR ที่สะอาดขนาด 0.2 มล. และทำเครื่องหมายด้วยส่วนผสมปฏิกิริยา 15μL ต่อหลุม
(3) เติมสารละลายกรดนิวคลีอิกบริสุทธิ์ 15μL ส่วนควบคุมเชิงบวกและส่วนควบคุมเชิงลบ และปิดฝาหลอดฐานแปดอย่างระมัดระวัง
(4) ผสมให้เข้ากันโดยกลับด้าน และปั่นแยกอย่างรวดเร็วเพื่อให้ของเหลวเข้มข้นที่ด้านล่างของหลอด
3. พีซีอาร์ ampลิฟcation -โปรดดูคู่มือการใช้งานเครื่องมือสำหรับการตั้งค่าการทำงาน-
3. 1 วางหลอด PCR 8 ลงในห้องตัวอย่างของเครื่องมือ PCR ฟลูออเรสเซนต์ และตั้งค่าตัวอย่างที่จะทดสอบ การควบคุมเชิงบวกและการควบคุมเชิงลบตามลำดับการโหลด
3.2 ช่องตรวจจับเรืองแสง:
(1) ยีน ORF1ab เลือกช่องทางการตรวจจับของ FAM (ผู้รายงาน: FAM, Quencher: ไม่มี)
(2) ยีน N เลือกช่องทางการตรวจจับของ VIC (ผู้รายงาน: VIC, Quencher: ไม่มี)
(3) ยีนมาตรฐานภายในเลือกช่องทางการตรวจจับของ CY5 (ผู้รายงาน: CY5, Quencher: ไม่มี)
(4) การอ้างอิงแบบพาสซีฟถูกตั้งค่าเป็น ROX
3.3 การตั้งค่าพารามิเตอร์โปรแกรม PCR:
ขั้นตอน | อุณหภูมิ(℃) | เวลา | จำนวนรอบ | |
1 | ปฏิกิริยาการถอดรหัสแบบย้อนกลับ | 50 | 15 นาที | 1 |
2 | การกระตุ้นเอนไซม์แท็ค | 95 | 2.5 นาที | 1 |
3 | การกระตุ้นเอนไซม์แท็ค | 93 | 10 วิ | 43 |
การขยายการหลอมและการได้มาของฟลูออเรสเซนซ์ | 55 | 30 วิ |
หลังจากตั้งค่าแล้วให้บันทึกไฟล์และรันโปรแกรมปฏิกิริยา
4.Results analysis
หลังจากโปรแกรมสิ้นสุด ผลลัพธ์จะถูกบันทึกโดยอัตโนมัติ และกราฟการขยายจะถูกวิเคราะห์ เส้นโค้งการขยายถูกตั้งค่าเป็นเกณฑ์เริ่มต้นของเครื่องมือ
-Explanation of test resuนิดหน่อย -
1. กำหนดความถูกต้องของการทดสอบ: FAM กลุ่มควบคุมเชิงบวก ช่อง VIC ควรมีกราฟการขยายโดยทั่วไป และค่า Ct โดยทั่วไปจะน้อยกว่า 34 แต่อาจผันผวนเนื่องจากการตั้งค่าเกณฑ์ที่แตกต่างกันของเครื่องมือที่แตกต่างกัน FAM ตัวควบคุมเชิงลบ, ช่อง VIC ไม่ควรขยาย Ct มีการตกลงกันว่าต้องปฏิบัติตามข้อกำหนดข้างต้นพร้อมกัน มิฉะนั้นการทดสอบนี้จะไม่ถูกต้อง
2. การตัดสินผลลัพธ์
ช่อง FAM/VIC | ผลการตัดสิน |
กะรัต <37 | ตัวอย่างการทดสอบเป็นบวก |
37≤Ct<40 | เส้นโค้งการขยายสัญญาณเป็นรูปตัว S และตัวอย่างที่น่าสงสัยจะต้องได้รับการตรวจสอบอีกครั้ง หากผลการตรวจซ้ำสม่ำเสมอจะถือว่าเป็นบวก ไม่เช่นนั้นจะเป็นลบ |
Ct≥40หรือไม่มีการขยาย | การทดสอบตัวอย่างเป็นลบ (หรือต่ำกว่าขีดจำกัดล่างของการตรวจพบชุดอุปกรณ์) |
หมายเหตุ: ( 1) หากทั้งช่อง FAM และช่อง VIC เป็นบวกในเวลาเดียวกัน แสดงว่า SARS-Cov-2 เป็นบวก
(2) หากช่อง FAM หรือช่อง VIC เป็นบวกและอีกช่องหนึ่งเป็นลบ ควรทำการทดสอบซ้ำ หากผลเป็นบวกจะถูกตัดสินว่าเป็นผลบวกของ SARS-Cov-2 มิฉะนั้นจะถูกตัดสินว่าเป็นผลลบของ SARS-Cov-2